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中心现有仪器设备绝大部分是国内一流、国际先进，涉及的品牌有Waters、Agilent、PE等，主要如下：
液相色谱-串联质谱仪（LC/MS/MS）、气相色谱-质谱仪（GC/MS）、电感耦合等离子体质谱仪（ICP-MS)、电感耦合离子体发射光谱仪（ICP）、气相色谱仪、液相色谱仪、离子色谱仪、原子吸收光度 仪、原子荧光光度计、傅立叶红外光谱仪、紫外/可见分光光度仪、快速溶剂萃取仪、微波消解装置、全自动固相萃取仪、粗纤维仪、脂肪抽提测定仪、定氮仪、全自动微生物鉴定及定量分析仪、荧光PCR仪、PCR扩增仪、凝胶成像系统、电泳仪、高速离心机、高压灭菌器等